Dos años después de la victoria sobre los Decepticons, la vida de Sam y los Autobots ha cambiado drásticamente. Mientras Sam se prepara para comenzar la universidad, sus amigos robots se han unido a una fuerza de élite para combatir a enemigos renegados. Sin embargo, todo cambia cuando un nuevo enemigo malvado emerge con un retorcido plan para resurgir los Decepticons. Una vez más, la humanidad está en peligro y Sam y los Autobots deben unirse para salvarla.